亚洲通:理学院王立飞教授在CDK2和CDK6两种蛋白的抑制剂选择性方面取得重要进展,研究成果以“Binding selectivity-dependent molecular mechanism of inhibitors towards CDK2 and CDK6 investigated by multiple short molecular dynamics and free energy landscapes”为题在生物物理领域著名学术期刊JOURNAL OF ENZYME INHIBITION AND MEDICINAL CHEMISTRY发表,该期刊属JCR分区1区,中科院分区2区,期刊影响因子为IF 5.756。
CDK2和CDK6是人体两种重要的丝氨酸-苏氨酸激酶,与癌症鉴别和发展方面关联紧密,因此CDK2和CDK6已成为癌症治疗靶点,引起了广大科研工作者的极大兴趣。在分子层面上理解不同抑制剂对这两种蛋白的选择性机制,能为以CDK家族为靶标的药物设计提供强有力的理论支持。本项研究工作采用多副本分子动力学模拟与MM-GBSA结合自由能算法相结合,探讨了三种小分子抑制剂X64、X3A和4AU对CDK2和CDK6的相结合选择性。研究结果表明X64、X34和4AU与蛋白结合焓和作用熵是驱动抑制剂选择性的关键因素。这项工作为设计CDK2和CDK6高效选择性抑制剂筛选以及抗癌药物设计提供了基础。
该项研究得到了国家自然科学基金项目以及分子建模与仿真科研平台资助支持。